从中世纪以来,就开始流传为了庆祝在武家出生的男孩而在端午节时于屋外挂上印有家纹的旗帜这样的风俗习惯。在江户时代这个活动更受到重视,并在5月5日端午节时使用菖蒲驱邪,所以端午节亦有「菖蒲节」的别称,武家将菖蒲与「尚武」结合举行年中活动并祈祷男孩的出人头地与武运长久。这天在武式的家庭中,会将祖先传承的铠与兜放在家中内侧坐垫上,并在玄关装饰上旗帜。
另一方面,虽拥有强大经济能力但社会地位仍低的商人家庭之中,从江户时代开始,为了对抗武士而以鲤鱼旗取代一般旗帜悬挂。以鲤鱼旗取代一般旗帜的原因,是因鲤鱼的谚语「鲤鱼跃龙门」这样能感受威势又被认为是吉祥的鱼并有助于飞黄腾达,再加上将五月晴朗的天空比拟为天空,鲤鱼就像在微风中优游自在游动般,这样不拘泥礼法自由奔放的做法在当时庶名蔚为风潮,而这样的情调至今能让人深刻感受。
根据中国的后汉书中的典故,在黄河的龙门这个地方,虽有许多鱼尝试越过瀑布,但仅有鲤鱼成功跳跃并化身为龙,而开始有了鲤鱼跃龙门象徵出人头地的说法。在那里,人们看着鲤鱼充满气势的姿态,祈求着孩子们的健康成长茁壮,而太阳照射到瀑布溅出的水花所产生五彩缤纷的闪耀色彩,则被认为是人们将旗帜漂动尾端设计成五种颜色的原因。
透过日本的基督教教会,在罗马教宗来日时当成贡献品,而JCRAFTS所贩售的原田光三商店的锂鱼旗在当时即被用来奉献。